Seminar at at NINA in Trondheim Thursday 15th September 2016
Downloading species occurrence data using the GBIF web-service API
The Global Biodiversity Information Facility (GBIF) provides a comprehensive e-infrastructure were data holding institutions can publish biodiversity data, and were researchers and other data analysts can access and download biodiversity data. Norway is one of the absolute largest data publishers in GBIF, but we still remain a more modest user of biodiversity data indexed into the global GBIF portal. This seminar will present some of the web-services and R-packages for accessing and downloading species occurrence data and taxonomic names made available in GBIF.
Tilgang og nedlasting av stedfestede artsdata fra GBIF med webtjenester
Global Biodiversity Information Facility (GBIF) leverer en omfattende e-infrastruktur der institusjoner med artsdata kan publisere sine datasett, og der forskere og andre som analyserer slike artsdata kan finne og laste ned data. Norge er et av de land som publiserer absolutt mest artsdata i GBIF, men nedlastning og bruk av artsdata fra GBIF er fortsatt på et mere moderat nivå sammenlignet med andre land. Dette seminaret presenterer noen av av webtjenestene og R-pakkene som er utviklet for å levere de mest effektive måter for å finen og laste ned artsdata fra GBIF portalen.
See also:
- http://www.gbif.org/developer/summary
- http://api.gbif.org/v1/
- https://dagendresen.wordpress.com/2015/09/11/downloading-occurrence-data-using-the-gbif-rest-api/
- http://www.slideshare.net/DagEndresen/gbif-api-hackaton-march-2015-leiden-sp2000gbif
- Persistent Identifiers: https://www.researchgate.net/publication/267631506
- GBIF API, slides: https://www.researchgate.net/publication/308802095
